素食者缺乏B12是最常被營養師關切的健康問題, B12 長期的缺乏可能導致神經方面的疾病, 甚至於可能會產生失明的問題, 所以素食者一般都會建議吃維他命B12 補充品

不過, 維他命B12 近年來被發現還可能扮演與心臟疾病預防有關的角色 , 因為一種半同胱氨酸酸 ( homocysteine) 被發現與心臟病有關, 心臟病人的homocysteine 通常都比較高

研究發現, homocysteine 可以被 攝取維他命B群所降低, 長期攝取充足的B6,B12 和葉酸者的homocysteine會降低, 不過這種降低的現象會不會隨之降低心血管疾病的機會, 仍然是有待更多的研究所證實

一般來說, 素食者體內的膽固醇是比較正常的, 長期吃素者雖然膽固醇正常, 心臟病的危險因子也少了一個, 但是, 卻可能因為B12 的缺乏而導致homocysteine 的上昇, 對於心臟病可能又多了一個危險因子, 兩者間如何取得均衡, 也是有待觀察

根據2000年五月的Annals of Nutrition & Metabolism 期刊的一篇捷克研究, B12缺乏普遍地發生在素食者的身上, 在一般肉食者不太容易發現, 而homocysteine的提高也同時發生在 29%的素食者身上, 一般人卻只有 5%, 可以見到 homocysteine的提高的確是比較普遍發生素食者身上的, 會不會因此增加心臟病危險, 有待觀察