一般而言，有五個常見的原因：第一為炎症反應－免疫或感染的問題，最常見的有腎炎與尿路感染，由尿液常規檢查與免疫學檢查可判斷；第二為尿路結石，結石的部位可分佈在腎臟、輸尿管、膀胱與尿道等各個不同部位，大致而言多有腰痛、腰酸與排尿疼痛等現象；第三為外傷，例如激烈運動與撞擊或挫傷後發生尿中帶血的反應，可從病史詢問得知；第四為化學品傷害，如空氣污染、過敏原、樟腦丸與抗血小板凝固劑等；第五為尿路系統腫瘤，最常見者為移行細胞癌，多好發於膀胱與腎臟，也有見於輸尿管與尿道，常見者為偶發之無痛性血尿，大部份人多不以為意，常再次或反覆性發生時才警覺到就醫之必要性。

臨床上對血尿之診斷學應包含：詳細之病史垂詢、常規尿液檢查、超音波、一般X光攝影與進一步特殊造影檢查以及尿細胞學檢查等，可作為血尿篩檢，免於誤診。第二個有關於排尿困難的層面；頻尿、夜尿、排尿不順暢等症狀，可歸因於尿路感染、尿路結石、攝護腺肥大或發炎合併排尿障礙，或有心因性的不穩定膀胱功能等，泌尿科專科醫師除通常的上述常規檢查外，會再進一步安排攝護腺超音波與動態性尿路機能檢查，確定其病因，方有利於血尿的治療。